蛋白表達方法對于能否及時獲取所需數量和質量的重z組蛋白非常關鍵。選擇了錯誤的表達宿主可能導致蛋白質錯誤折疊或低量表達.缺少必要的翻譯后修飾或不適當的修飾。選擇表達系統時需騎慮的因素包括蛋白質的大小、二硫鍵的數目、所需翻譯后修飾的類型及目標蛋自質的定位。
 

　　蛋白表達的幾種常用標簽介紹：
 

　　GST(谷胱甘肽巰基轉移酶) 標簽蛋白本身是一個在解毒過程中起到重要作用的轉移酶，它的天然大小為26KD。將它應用在原核表達的原因大致有兩個，一是因為它是一個高度可溶的蛋白，希望可以利用它增加外源蛋白的可溶性；另一個是它可以在大腸桿菌中大量表達，起到提高表達量的作用。
 

　　His6是指六個組氨酸殘基組成的融合標簽，可插入在目的蛋白的C末端或N末端。當某一個標簽的使用，一是能構成表位利于純化和檢測；二是構成結構特征(結合配體)利于純化。組氨酸殘基側鏈與固態的鎳有強烈的吸引力，可用于固定化金屬螯合層析(IMAC)，對重組蛋白進行分離純化。
 

　　MBP(麥芽糖結合蛋白)標簽蛋白大小為40kDa，由大腸桿菌K12的malE基因編碼。MBP可增加在細菌中過量表達的融合蛋白的溶解性，尤其是真核蛋白。MBP標簽可通過免疫分析很方便地檢測。有必要用位點專一的蛋白酶切割標簽。如果蛋白在細菌中表達，MBP可以融合在蛋白的N端或C端。
 

　　Flag標簽蛋白為編碼8個氨基酸的親水性多肽(DYKDDDDK)，同時載體中構建的Kozak序列使得帶有FLAG的融合蛋白在真核表達系統中表達效率更高。
 

　　SUMO標簽蛋白是一種小分子泛素樣修飾蛋白(Small ubiquitin-likemodifier)，是泛素(ubiquitin)類多肽鏈超家族的重要成員之一。